Mitra penyelenggara autodebet BPJS Kesehatan dibagi menjadi 2 yaitu Bank dan Non Bank, berikut ini adalah list mitra penyelanggara autodebet beserta sumber pendanaannya:
| No | Nama Mitra | Sumber Pendanaan | Tanggal Pendebetan | Akses Pendaftaran |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Bank Mandiri | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | Mobile JKN, Website BPJS Kesehatan, Kantor Cabang Bank, Kantor Cabang BPJS Kesehatan |
| 2 | Bank BNI | Rekening Tabungan & Kartu Kredit | 5 dan 20 | Kantor Cabang Bank, Kantor Cabang BPJS Kesehatan |
| 3 | Bank BRI | Rekening Tabungan | Setiap hari | Kantor Cabang BPJS Kesehatan |
| 4 | Bank BTN | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | Kantor Cabang BPJS Kesehatan dan Kantor Cabang Bank |
| 5 | Bank BCA | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | Kantor Cabang BPJS Kesehatan dan Kantor Cabang Bank |
| 6 | Bank Panin | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | ATM Bank Panin, Kantor Cabang Bank |
| 7 | Bank Citibank | Kartu Kredit | 5 dan 20 | Call Center Bank |
| 8 | Bank Standard Chartered | Kartu Kredit | 5 dan 20 | Call Center Bank |
| 9 | Bank Jateng | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | Kantor Cabang BPJS Kesehatan dan Kantor Cabang Bank |
| 10 | PT. Finnet Indonesia | Uang elektronik Finpay/Mobile Cash | Setiap hari | Mobile JKN. Top up akun : Pos, Alfamart, Transfer antar bank |
| 11 | Tokopedia | Uang elektronik OVO, Debit dan Credit Card | Setiap hari | Aplikasi Tokopedia |
| 12 | Bank Nagari | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | Kantor Bank |
| 13 | PT. Nusa Satu Inti Artha | Uang Elektronik DOKU Wallet | Setiap hari | Mobile JKN |
| 14 | PT. Nusa Satu Inti Artha | Kartu Kredit / Debit VISA/Mastercard | Setiap hari | Mobile JKN, Website BPJS Kesehatan |
| 15 | CIMB Niaga | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | e-Banking CIMB Niaga |
| 16 | DANA | Uang Elektronik DANA | Setiap hari | Aplikasi DANA |
| 17 | PT. Dompet Anak Bangsa | Uang Elektronik Gopay | Setiap hari | Aplikasi Gojek |
| 18 | Shopee | Uang elektronik Shopee pay | Setiap hari | Aplikasi Shopee |
| 19 | Bank Jatim | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | Kantor Bank |
| 20 | PT. Indomarco Prismatama | Uang elektronik i-Saku | Setiap hari | Aplikasi i-Saku |
| 21 | Bank BSI | Rekening Tabungan | 5 dan 20 | Kantor Bank, Kantor BPJS Kesehatan |